Resultado de las elecciones autonómicas del día 13 de junio de 1999
8 de julio de 1999 El Parlamento elige Presidente a Rafael de la Sierra González (hasta el 19 de junio de 2003), del PRC. Tras la correspondiente sesión de investidura, el 22 de julio de 1999 el Parlamento elige Presidente del Gobierno Autónomo a José Joaquín Martínez Sieso, del PP, con los votos de su formación más los del PRC. Los 14 diputados socialistas votaron en contra.
22 de septiembre de 1999 Visita institucional de S.A.R. el Príncipe de Asturias al Parlamento de Cantabria. Febrero de 2002 El Parlamento celebra el 20 aniversario de la entrada en vigor del Estatuto de Autonomía para Cantabria.
25 de mayo de 2003 Se celebran las sextas elecciones autonómicas. El Parlamento queda conformado por 18 Diputados y Diputadas del PP, 13 del PSOE y 8 del PRC.